浅谈噬菌体生物库的建设

当前的噬菌体治疗常常需要根据患者感染的细菌快速匹配出合适的噬菌体以进行个体化治疗。这种情况下，建立存储有大量噬菌体的噬菌体生物库对提高患者感染细菌与噬菌体的匹配速度至关重要。
一个综合性的噬菌体生物库，必须对噬菌体的收集和数据整理等进行有效的管理。理想状态下，噬菌体生物库的建立应该能满足本国甚至全球使用的噬菌体资源和数据。本文以澳大利亚噬菌体生物库建库的背景，了解建立一个国家级噬菌体资源库，应该具备的几大基本特征。
1.集中管理 
一个有效的噬菌体生物库将作为一个网络中心点，通过共享协议将噬菌体资源与临床应用有机连接，并进行有效管理。
2.标准化的程序 
对噬菌体的分离、纯化、鉴定和加工环节，制定标准化的程序，有效的提高噬菌体收集、存储和运输的效率。拟定一份标准化的跨机构噬菌体转移协议模板，让参与者能够从噬菌体库快速的获取噬菌体。另外，引入国际标准化的质量管理系统将有助于保证质量，提高使用者和相关利用者之间的信心。
3.标准化的定义 
根据国际病毒分类委员会制定的标准，对噬菌体生物库里的噬菌体进行基因组测序和标准化的基因组注释非常重要，将促进生物标本导航平台的使用，并允许开发简单有效的工具，例如“噬菌体护照（ID）”。更具体的说就是，标准化噬菌体产品的质量参数。关于“噬菌体护照”的定义，可能会有区域性的差异，但是理想状态下应该是共同商定全球适用。可根据图2了解“噬菌体护照”规则纳入噬菌体临床治疗策略的重要性。
4.有效的诊断 
噬菌体的临床应用需要将患者感染的细菌与候选噬菌体进行匹配，甚至需要测定噬菌体与抗生素联用的效果。这些治疗前诊断在噬菌体生物库进行是最合适的，将噬菌体与细菌的监测系统整合起来，有助于匹配上最有效的噬菌体。
5.数据管理 
标准化的数据管理和高效的实验室信息管理系统很有必要的，其中生物标本导航平台可以快速的定位噬菌体制剂存放的具体位置。另外，将已发表的噬菌体试验数据、未发表的和同行评审的临床研究和病例报告以及其他公开的可用数据整合起来，促进合作，为未来的临床实验提供信息，让研究人员和临床医生能够借鉴，并进行有效的合作。对这些数据进行整理时，最好成立专家小组进行有效的审查。
6.制造和生产 
当前包括有雾化、敷料、灌洗、注射等几种噬菌体给药途径被证明对治疗人类感染的细菌是有效的。其中，高纯度、安全含量内毒素的噬菌体制备是噬菌体进行静脉注射治疗时必须的。如何提高高质量的噬菌体的制备工艺和基础设置，有效的对噬菌体生产进行管理，以确保精准的靶向治疗，也是噬菌体生物库建设中需要思考的一个重要环节。
综上所述，在任何噬菌体生物库的建设过程中都是需要综合考虑道德、法律、财务和管理等因素。如何建立一种合理的商业模式，以简化用于制药和生物技术研发的临床菌株和噬菌体获取是值得思考的问题。另外，有公共资金、政府机构支持和合作对噬菌体生物库的可持续发展也是至关重要的，一个全球范围适用的互联共通的噬菌体生物库的建立对于减抗行动，遏制耐药菌感染是有重要意义的。
参考文献：
Lin, R.C., et al., PhageBiobank: Present Challenges and Future Perspectives. Curr Opin Biotechnol,2021. 68: p. 221-230.