噬菌体分布极广，凡是有细菌的场所，就可能有相应噬菌体的存在。在人和动物的排泄物或污染的井水、河水中，常含有肠道菌的噬菌体。
在微生物界，同样存在类似动植物界的食物链一样的关系。“捕食”细菌的，正是科学家们研究微生物的一种强有力的工具：噬菌体。
目前治疗细菌感染主要使用抗生素，但随着抗生素耐药问题日益严重，迫切需要新的治疗方法，其中一种选择就是噬菌体疗法。
抗生素曾一度是致病菌的天敌。由于抗生素的滥用，细菌产生耐药性的速度远高于新抗生素研发的速度，导致了“超级耐药菌”的出现，堪称细菌中的“小强”。
正常情况下肠道菌群与机体处于共生关系：一方面，宿主为正常菌群的生长和繁殖提供营养和场所，并且不对它们产生强烈的免疫反应(免疫耐受)；另一方面，菌群对宿主的健康和疾病至关重要，在宿主防御外源性感染、促进免疫系统的成熟与平衡及营养与代谢等方面发挥不可缺少的生理功能。
随着医药产业的发展，中兽药新制剂、新产品的研究开发在不断增强。中兽药在生物药和化药的双重挤压下，市场销售占比压缩到10%以下，许多中兽药产品面临停产。
